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脈孢菌的特征和在生物技術(shù)中的用途

脈孢菌屬子囊菌屬真菌,俗稱紅面包霉菌?!癗eurospora”這個名字來自性孢子上的神經(jīng)狀條紋,也稱為子囊孢子。它們產(chǎn)生稱為分生孢子的橙色無性孢子。N. crassa 是該屬的著名物種,已廣泛用于表觀遺傳學(xué)、晝夜節(jié)律、光生物學(xué)等許多研究。脈孢菌在無性階段產(chǎn)生單倍體孢子(分生孢子),發(fā)芽形成多個分枝的菌絲,它們結(jié)合在一起形成菌絲體。在有性生殖中,不同的交配型菌株融合在一起形成子實體。這些子實體(perithecia)將子囊孢子射向光線。

神經(jīng)孢子菌在自然棲息地,圖片描繪了葡萄牙一棵被燒毀的樹上的粗糙豬籠草的生長

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文章索引(點擊跳轉(zhuǎn))

有助于研究的脈孢菌特征

  • 10-15 天的短暫生命周期有助于研究人員在短時間內(nèi)獲得結(jié)果。

  • 它們是單倍體,這意味著與人類不同,它們只有一組染色體。這有助于在后代中表達顯性和隱性基因。

  • 已繪制出脈孢菌的全基因組圖。這有助于研究人員通過基因操作創(chuàng)造基因敲除來識別每個基因的作用。

  • 脈孢菌在四分體分析中很有用。四分體,一組四個孢子,是減數(shù)分裂的結(jié)果。這有助于研究人員研究減數(shù)分裂、交叉和重組等現(xiàn)象。

  • 脈孢菌優(yōu)于其他模式生物,如大腸桿菌和釀酒酵母,因為它們與高等真核生物具有相似的特征,如 DNA 甲基化、晝夜節(jié)律等。

  • 遺傳操作工具可用于脈孢菌屬。野生型和突變(敲除)菌株很容易獲得,有助于分析特定基因的作用。

用途

在生物技術(shù)研究

N. crassa 是 Dodge 在 20 年代后期第一個用作實驗?zāi)P偷奈锓N。從那時起,它被廣泛用于許多研究,如光生物學(xué)、表觀遺傳過程、種群生物學(xué)、晝夜節(jié)律等。Neurospora 是 Beadle 和塔圖姆。根據(jù)這一理論,每一個基因都編碼一種酶,該酶又負責(zé)代謝途徑中的一個步驟。他們通過將孢子暴露于輻射來制造脈孢菌突變體,并將它們在含有最少培養(yǎng)基的單獨試管中生長。他們觀察到突變孢子在基本培養(yǎng)基中死亡,因為它們無法制造其生長所需的特定關(guān)鍵分子。

在研究晝夜節(jié)律

晝夜節(jié)律是一個 24 小時的生物鐘,它使內(nèi)部生理與外部世界同步。它也被稱為睡眠-覺醒周期。這些是主要對光明和黑暗做出反應(yīng)的身體和行為變化。晝夜節(jié)律是幾乎所有生物中都存在的內(nèi)生時鐘。脈孢菌一直是研究人類晝夜節(jié)律過程和生理學(xué)的重要模型。像人類一樣,脈孢菌屬的晝夜節(jié)律具有三個部分——輸入、中央振蕩器和輸出。中央振蕩器的功能是產(chǎn)生大約 24 小時的節(jié)奏。核心復(fù)合物有兩組蛋白質(zhì)對,負臂和正臂。負臂包含 FRQ/FRH 復(fù)合體 (FFC) 和 CK1,而正臂包含白領(lǐng)復(fù)合體 (WWC)。WWC由WC1和WC2組成,刺激 frq 的表達。在脈孢菌屬中,晝夜節(jié)律開始于主觀夜間,此時 WCC 與 frq 啟動子結(jié)合并開始 frq mRNA 的翻譯。FRQ 蛋白與 FRH 結(jié)合形成 FRQ-FRH 復(fù)合物 (FFC),然后進入細胞核。在細胞核中,它與 CK1 形成復(fù)合物,通過磷酸化 WCC 來抑制 WCC。WCC 最終停止 frq 翻譯并退出核。到下午晚些時候,缺乏 WCC 會降低 FRQ 的合成。這導(dǎo)致 FRQ 被 SCF-泛素連接酶復(fù)合物降解。未結(jié)合的 WCC 然后結(jié)合 frq 啟動子并開始將其翻譯成 FRQ 蛋白,然后循環(huán)再次開始。FRQ 蛋白與 FRH 結(jié)合形成 FRQ-FRH 復(fù)合物 (FFC),然后進入細胞核。在細胞核中,它與 CK1 形成復(fù)合物,通過磷酸化 WCC 來抑制 WCC。WCC 最終停止 frq 翻譯并退出核。到下午晚些時候,缺乏 WCC 會降低 FRQ 的合成。這導(dǎo)致 FRQ 被 SCF-泛素連接酶復(fù)合物降解。未結(jié)合的 WCC 然后結(jié)合 frq 啟動子并開始將其翻譯成 FRQ 蛋白,然后循環(huán)再次開始。FRQ 蛋白與 FRH 結(jié)合形成 FRQ-FRH 復(fù)合物 (FFC),然后進入細胞核。在細胞核中,它與 CK1 形成復(fù)合物,通過磷酸化 WCC 來抑制 WCC。WCC 最終停止 frq 翻譯并退出核。到下午晚些時候,缺乏 WCC 會降低 FRQ 的合成。這導(dǎo)致 FRQ 被 SCF-泛素連接酶復(fù)合物降解。未結(jié)合的 WCC 然后結(jié)合 frq 啟動子并開始將其翻譯成 FRQ 蛋白,然后循環(huán)再次開始。

作為光生物學(xué)研究的模型

光影響幾乎所有生物的生物和生理過程。脈孢菌已被用作研究生物反應(yīng)的工具,例如光在控制晝夜節(jié)律中的作用、有性(子囊孢子)和無性(分生孢子)結(jié)構(gòu)的發(fā)育、子囊孢子傳播的方向等。研究發(fā)現(xiàn),這些生物對光的反應(yīng)涉及光誘導(dǎo)的脈孢菌基因調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn),近 5.6% 的基因在受光刺激時表現(xiàn)出快速轉(zhuǎn)錄。研究發(fā)現(xiàn),造成脈孢菌的光反應(yīng)主要是紫外線/藍光。對突變體的遺傳分析表明,光感受器 WC-1 和 WC2 形成了一個復(fù)雜的 WCC,它與特定的 DNA 序列結(jié)合并開始表達許多光響應(yīng)基因。

脈孢菌DNA甲基化研究

DNA甲基化是通過將甲基轉(zhuǎn)移到DNA中的胞嘧啶上來調(diào)節(jié)基因表達的表觀遺傳過程。胞嘧啶的甲基化抑制轉(zhuǎn)錄因子與 DNA 序列的結(jié)合。在真核生物中,DNA甲基化在基因組印記、基因沉默和X染色體失活等過程中發(fā)揮著重要作用。脈孢菌已被證明是研究 DNA 甲基化的原因和作用的優(yōu)秀系統(tǒng)。DNA 甲基化在脈孢菌中不是強制性的,使其成為研究甲基化的重要模型。對脈孢菌屬、擬南芥屬和小鼠的研究表明,在不同的真核生物和原核生物中,DNA甲基化的功能和過程存在相似之處。發(fā)現(xiàn)阻斷脈孢菌中組蛋白的去乙?;瘯档?DNA 甲基化。還發(fā)現(xiàn)脈孢菌中dim5和dim2基因的突變阻礙了DNA甲基化的過程。研究表明,在脈孢菌中,DNA 甲基化依賴于 DIM-2(DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶),由 DIM-5(組蛋白 H3 甲基轉(zhuǎn)移酶)指導(dǎo)。科學(xué)家們從脈孢菌中分離出甲基化 DNA,發(fā)現(xiàn)甲基化序列由因重復(fù)序列而發(fā)生突變的轉(zhuǎn)座子組成。這些研究得出結(jié)論,脈孢菌屬使用 DNA 甲基化作為防御機制來對抗重復(fù)或重復(fù)的序列(轉(zhuǎn)座因子)??茖W(xué)家們從脈孢菌中分離出甲基化 DNA,發(fā)現(xiàn)甲基化序列由因重復(fù)序列而發(fā)生突變的轉(zhuǎn)座子組成。這些研究得出結(jié)論,脈孢菌屬使用 DNA 甲基化作為防御機制來對抗重復(fù)或重復(fù)的序列(轉(zhuǎn)座因子)??茖W(xué)家們從脈孢菌中分離出甲基化 DNA,發(fā)現(xiàn)甲基化序列由因重復(fù)序列而發(fā)生突變的轉(zhuǎn)座子組成。這些研究得出結(jié)論,脈孢菌屬使用 DNA 甲基化作為防御機制來對抗重復(fù)或重復(fù)的序列(轉(zhuǎn)座因子)。

脈孢菌中的程序性細胞死亡 (PCD)

程序性細胞死亡,也稱為細胞自殺,是一個去除不需要的細胞的過程。在這個過程中,不需要的細胞通過細胞凋亡或自噬從體內(nèi)清除。各種觸發(fā)因素,如暴露于壓力、病毒入侵可導(dǎo)致脈孢菌中的程序性細胞死亡。PCD 還涉及其他生命過程,如有性和無性生殖、衰老、真菌非自我識別。當(dāng)基因不同的菌株之間發(fā)生菌絲融合時,會發(fā)生脈孢菌中的細胞死亡。這會觸發(fā)融合室和相鄰細胞中的細胞死亡,導(dǎo)致異核體形成排斥,這被稱為異核體不相容性。這些不相容的異核體中的程序性細胞死亡導(dǎo)致質(zhì)膜收縮 DNA 凝聚,然后是細胞死亡。據(jù)觀察,某些化學(xué)物質(zhì),如植物鞘氨醇 (PHS) 也可以誘導(dǎo)脈孢菌中的細胞死亡。PHS 是一種具有抗真菌特性的鞘脂。研究人員表明,用 PHS 治療脈孢菌會導(dǎo)致 ROS(活性氧)產(chǎn)生、冷凝和 DNA 片段化,從而導(dǎo)致細胞死亡。

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