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Western Blot為什么必須要用內(nèi)參?

要檢測一個基因的表達(dá)產(chǎn)物是否正確,或者比較表達(dá)產(chǎn)物量的相對變化,**方法是Western Blot。因?yàn)閃estern Blot操作相對簡單方便,既可以定性分析表達(dá)產(chǎn)物,同時還可以指示目的蛋白量的相對變化。雖然,順利的時候Western Blot做起來很簡單,可不順的時候也很令人心煩――做不出結(jié)果啦、假陽性啦、結(jié)果出現(xiàn)多條帶啦、到底是一抗有問題還是二抗有問題啦……畢竟,作為一種有 活性的生物大分子,抗體和抗原的反應(yīng)畢竟不象1+1那么明確,而用這種不確定的試劑來測定同樣知之甚少的表達(dá)產(chǎn)物,確實(shí)是有一定的不確定性的。所以,嚴(yán)謹(jǐn) 的Western Blot實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中要求有良好的參照體系,對實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析是非常有用。特別是當(dāng)實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)問題時,借助參照體系很容易就可以查出問題所在,而不必抓耳撓腮怨 天尤人。良好的參照體系通常包括分子量Marker(用來確定蛋白條帶對應(yīng)的分子量大?。瞻纵d體對照(如果是誘導(dǎo)表達(dá)體系還應(yīng)該有誘導(dǎo)前的對照),已 知量標(biāo)準(zhǔn)產(chǎn)物的正對照;另外還有內(nèi)參??墒怯捎诮?jīng)費(fèi)限制或者偷懶的原因,國內(nèi)的不少人做Western Blot往往省略參照,導(dǎo)致結(jié)果出現(xiàn)問題時無法分析結(jié)果――即便有結(jié)果也可能影響結(jié)果的分析。

        內(nèi)參是**容易被忽略的一項(xiàng)。我們知道,要用Western Blot比較不同條件下或者不同組織中,目的蛋白表達(dá)量的相對多少,前提條件是等量的細(xì)胞上樣,才有比較的基礎(chǔ)。特別表達(dá)量不高時,上樣量的差別就很可能影響結(jié)果的分析。所以你需要內(nèi)參。

        內(nèi)參即是內(nèi)部參照(Internal Control),對于哺乳動物細(xì)胞表達(dá)來說一般是指由管家基因編碼表達(dá)的蛋白(Housekeeping Proteins),它們在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對恒定,在檢測蛋白的表達(dá)水平變化時常用它來做參照物。在Western Blotting 實(shí)驗(yàn)中,除了需要進(jìn)行蛋白抽提、蛋白定量、等量蛋白上樣電泳、轉(zhuǎn)膜、靶蛋白抗體孵育、顯色等步驟以外,還需要進(jìn)行內(nèi)參的檢測,以校正蛋白質(zhì)定量、上樣過程中存在的實(shí)驗(yàn)誤差,保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性。

        在國外發(fā)表的文章中,Western Blotting 實(shí)驗(yàn)結(jié)果須進(jìn)行內(nèi)參校正已成為一種慣例。但是,國內(nèi)仍有不少科研人員在Western Blotting實(shí)驗(yàn)中忽略了內(nèi)參的使用,將蛋白濃度測定作為規(guī)范需相互比較的各種樣品間上樣量等同的**方法。然而各種蛋白質(zhì)濃度定量方法,都存在局限性,不能完全準(zhǔn)確的確定各種樣品的準(zhǔn)確蛋白濃度。如UV法直接定量,適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質(zhì),相對于比色法來說,操作簡單,但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,如DNA 的干擾;且敏感度低,要求蛋白的濃度較高。比色法測定蛋白濃度一般有BCA,Bradford,Lowry 等幾種方法。BCA法與Lowry法都容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾。Bradford 法敏感度**高,且與一系列干擾Lowry,BCA 反應(yīng)的還原劑(如DTT,巰基乙醇)相容。但是對于去污劑依然是敏感的,其**主要的缺點(diǎn)是不同的標(biāo)準(zhǔn)品會導(dǎo)致同一樣品的結(jié)果差異較大,無可比性。另外,蛋 白質(zhì)定量以后進(jìn)行電泳時需要等量上樣,此步驟也存在操作誤差。在Western blotting實(shí)驗(yàn)時使用內(nèi)參,即可簡便地對定量和上樣步驟產(chǎn)生的誤差進(jìn)行校正。

        在Western Blotting中使用內(nèi)參其實(shí)就是在WB過程中的另外用內(nèi)參對應(yīng)的抗體檢測內(nèi)參,這樣在檢測目的產(chǎn)物的同時可以檢測內(nèi)參的表達(dá),由于內(nèi)參在各組織和細(xì)胞 中的表達(dá)相對恒定,借助檢測每個樣品內(nèi)參的量就可以用于校正上樣誤差,這樣半定量的結(jié)果才更為可信。此外使用內(nèi)參可以作為空白對照,檢測蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否 完全、整個Western Blot顯色或者發(fā)光體系是否正常。

        實(shí) 驗(yàn)結(jié)果分析其實(shí)很簡單:如果樣品蛋白量有限,只夠進(jìn)行一次電泳轉(zhuǎn)膜實(shí)驗(yàn)時,分別檢測樣品的內(nèi)參量和目的蛋白量。將各樣品目的蛋白量分別除以其內(nèi)參含量,得 到的數(shù)值即為內(nèi)參校正后的各樣品中目的蛋白相對含量,再用此數(shù)值進(jìn)行樣品間的比較和分析,得到目的蛋白含量在不同樣品間的實(shí)際變化結(jié)果。如果樣品量充分, 可以先檢測內(nèi)參,觀測樣品間內(nèi)參顯色條帶是否一致,根據(jù)差異大小調(diào)整各樣品的上樣量重新進(jìn)行Western Blotting實(shí)驗(yàn),**內(nèi)參量一致為止;若內(nèi)參一致,即可進(jìn)行不同樣品間目的蛋白表達(dá)變化分析。這樣雖然麻煩一點(diǎn),但是可以保證結(jié)果更有說服力,更可信。畢竟我們的實(shí)驗(yàn)是一種嚴(yán)謹(jǐn)?shù)墓ぷ鳌?br />
        附:在Western Blotting實(shí)驗(yàn)過程中使用內(nèi)參的方法有:

        一、 超級簡便的標(biāo)記內(nèi)參使用法:只要在二抗孵育時加入HRP標(biāo)記內(nèi)參抗體,按照正常操作即可。

        二、普通內(nèi)參:當(dāng)目的蛋白的分子量大小與選用的內(nèi)參蛋白分子量相差不大時,可以先進(jìn)行目的蛋白的抗體溫育顯色和檢測。然后使用Strip緩沖液洗掉膜上的抗體,重新進(jìn)行內(nèi)參蛋白的抗體溫育、顯色檢測。

        三、當(dāng)目的蛋白的分子量大小與選用的內(nèi)參蛋白分子量大小相差比較明顯情況下,可以在轉(zhuǎn)膜后預(yù)染,根據(jù)蛋白質(zhì)Marker的大小將膜剪為大分子量和小分子量兩部分,使內(nèi)參蛋白與目的蛋白分開。然后兩塊膜分別與內(nèi)參蛋白抗體以及目的蛋白抗體進(jìn)行溫育,二抗溫育以及顯色。
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